Voor wat betreft de positie van Bayliss was de race vergelijkbaar met de eerste race in Portimão. Bayliss reed zich al snel los van het veld en pakte de dubbel voor Michel Fabrizio en Leon Haslam.
Bij de start was het Ruben Xaus die als eerste bij de eerste bocht kwam met daarachter Jonathan Rea en Troy Bayliss. De drievoudig wereldkampioen kwam echter, net als in de eerste race, al snel naar voren en vanaf het moment dat hij op kop lag begon hij aan een riante voorsprong te werken.
Achter hem werd weer flink gebakkeleid tussen Xaus, Rea, Troy Corser, en Noriyuki Haga waarbij vooral Haga sterk voor de dag kwam. De Japanner klom al snel op naar de tweede positie maar toen bleek dat Haga een jumpstart had gemaakt waarvoor hij een ride-through kreeg opgelegd. Haga zou uiteindleijk nog als 14e over de finish komen.
Xaus nam de leiding weer over van Haga en zou het aan de stok krijgen met de naar voren gekomen Michel Fabrizio. Toen de Italiaan de Spanjaard voor de tweede keer gepasseerd was, ging Xaus onderuit en daarbij moest Carlos Checa een flink eind om om Xaus en zijn machine te ontwijken. Vlak daarvoor was Rea al een keer veel te wijd gegaan om na een excursie door de grindbak weer de baan op te komen.
Fabrizio kreeg door deze akkefietjes een gaatje naar Max Neukirchner die de derde plaats had ingenomen. Neukirchner zou in de eindfase echter nog gepasseerd worden door Haslam.
Fonsi Nieto wist ook in de tweede race de vijfde plaats te pakken nadat hij Troy Corser had weten te passeren. Checa werd uiteindelijk nog zevende voor Gregorio Lavilla, Cal Crutchlow en Régis Laconi.