In de tweede vrije training van de 125cc klasse op Sepang, was Bancaja Aspar rijder Julian Simon veruit de snelste rijder van het veld. De Spanjaard was de enige coureur die onder de 2’14 wist te blijven. Marc Marquez eindigde de sessie als tweede, gevolgd door Bradley Smith op de derde plek.
De temperaturen op het Maleisische circuit waren aanzienlijk lager dan tijdens de eerste dag, maar de luchtvochtigheid was opgelopen tot 70%. 125cc wereldkampioen Simon ondervond hier echter weinig problemen van en reed meer dan een seconde sneller dan de snelste tijd van vrijdag, die door zijn teamgenoot Bradley Smith was neergezet.
Met een tijd van 2’13.459 was Simon 0.732s sneller dan Red Bull KTM rijder Marquez en 0.873s sneller dan de Engelsman Bradley Smith. Smith was tijdens de eerste vrije training op vrijdag de enige rijder die onder de 2’15s wist te blijven, terwijl op zaterdagochtend de gehele top tien onder deze grens wist te rijden.
Nico Terol (Jack & Jones Team) en Pol Espargaró (Derbi Racing Team) werden respectievelijk vierde en vijfde, Sergio Gadea (Bancaja Aspar), Joan Olivé (Derbi Racing Team), Jonas Folger (Ongetta Team I.S.P.A.), Sandro Cortese (Ajo Interwetten) – die nog een kleine crash had – en Efrén Vázquez (Derbi Racing Team) stonden in de top tien van de tweede vrije training op Sepang.
De Graaf Grand Prix rijders Krummenacher en Webb eindigden achter elkaar op de 14e en 15e plek, terwijl Jasper Iwema tijdens de ochtendsessie een 28e tijd neerzette.